故事主题：精神关怀还是人性反省？

　　徐克如是说：

　　“起初在看到内地版本时感动胜过对剧情在商业上的处理，虽然几处较为出彩的悬疑、惊悚情节被删减，但一部恐怖片改成一部并不简单纯粹的爱情片也不失为一部好片子。”

　　“如果大家觉得高静是精神病患者，那我需要指出的是，影片始终以高静自居，让观众跟着她的内心感觉走，我不会最终让大家只感觉是在同情、可怜一个精神病人的爱情。这一点很遗憾，我承认部分镜头切换的（指广局的删减）有点牵强或仓促了。”

　　完整的故事梗概：是爱情？伦理？悬疑？惊悚？……

　　徐克解释：

　　起初的《深海寻人》叫《深海寻尸》，此后又动过《深海寻夫》的念头，但最终只以一‘人’字代替，既指大家都明白的男主人公国栋，同时暗示另有一‘尸’埋藏深海。那尸体就是上海女人苏珍箐，她是小凯（梁洛施饰）在上海念书期间的同学，在同窗期间，小凯的性取向逐渐偏移了正确的轨道，渐渐把爱慕投向了苏，但最终看到苏和一个男同学相恋，便支身离开上海，投奔哥哥。由于小凯内心始终相思苏，渐渐患上心理紧张和忧郁，便找到了心理医生simon（张震饰）恰巧遇见病友高静（李心洁饰），对她和苏酷似的外貌与气质吸引，两人成了无话不谈的贴心好友。而此时小凯接到苏的电话，对方哭诉和男友分手，约小凯去‘与那国岛’游玩散心，于是小凯迫不及待的赶往冲绳，却带上了高静陪同。三人在海上嬉闹时，小凯情不自禁的亲吻了苏（此处有露点镜头），还向苏表白了对她的爱意，得到的却是苏的一记耳光，小凯感觉自尊受到严重伤害，和苏在岸边扭打起来，赶来帮忙的高静却误将苏打昏，怒火中烧的小凯割下苏的头颅，和高静一起潜水分别将苏的尸体和人头分别藏匿于深海之中。从此高静内心产生了对苏的梦魇。每晚都会听见苏在水下的低吟声，还会在电梯里看到黑衣人的幻觉。而小凯哥哥国栋（郭晓冬饰）的出现冲淡了她内心的心魔，二人一见如故，爱情逐渐升温，一年后，他们来到逐渐已被高静淡忘掉的与那国岛潜水，国栋在水下安排了一场浪漫的求婚仪式。可就在二人浅到80米海下时，意外发生了……由于连续工作三天，高静出现氦昏迷状态，国栋只好拖她上岸，但当她渐渐向水面上升的时候，面前岩石夹缝中一颗头颅出现在高静视线中，这正是当年被他亲手藏匿在此处的苏的头颅，瞬间，压抑、埋藏于高静内心的心魔彻底爆发，她回过头，产生了幻觉，身后抱着自己的国栋变成了苏的厉鬼，于是他拼命的撕打国栋，可还是无法抽身，慌乱中顺手抽出匕首正巧扎在了国栋的动脉。此时下水营救的小凯带着高静离开了水下，当她再下水去营救哥哥的时候，看到他正在冒血，可是，她却停顿了，她想得到高静，和她终生厮守。最终放弃了哥哥的生命，独自上了岸。回到家的小凯把受惊过度的高静安置在医院精神科，此时才是故事的开始，观众跟随高静的内心走过一段恐怖、惊悚的历程，最终的揭晓的谜底才是刚才所说的真相。而当高静记忆恢复，得知真相后，带着对国栋的爱和对苏珍箐的惭愧，投海自尽。就是这样的一个故事。

　　删减版内地上映反应: 进入惊悚的高潮段落时，梁洛施(听歌)扮演的小凯被鬼附身的段落，小凯的眼神表情都变得阴森，常带莫名其妙的笑意，当她如鬼魅般出现在李心洁的家里时，现场静得听不到一点声音。当她和李心洁打斗起来，突然把对方掀翻到阳台外时，有女观众惊叫出声甚至从座椅上跳了起来，而坐在一旁的男伴赶紧拍肩抚慰。影片进入尾声时，李心洁缓缓走入大海，梁洛施跪在海滩上哭，影院里有人小声抽泣。放映结束后，有观众议论刚才的镜头到底是什么意思厅，也有观众感叹说：“几好啊！好感人！”也有观众说：“好看是好看，但是不是很明白，再看一遍吧。”